Lorsque le corps transporte le sang vers le cœur, le cœur pompe l'oxygène dans le sang. Les artères transportent ensuite le sang riche en oxygène dans différentes zones du corps. L' artère rectale inférieure transporte le sang oxygéné vers la partie inférieure de l'anus et du canal anal. Le canal anal est la partie terminale du gros intestin qui pousse les déchets dans le rectum pour les expulser du corps.
L'artère se sépare de l' artère pudendale interne, qui fournit le flux sanguin aux organes génitaux situés à l'extérieur du corps, comme le pénis. L'artère se divise en trois segments qui traversent les os du bassin. Chaque branche fournit du sang aux muscles situés dans la région anale.
L'artère rectale inférieure fournit du sang oxygéné au grand fessier, qui est le plus gros muscle des fesses humaines. L'artère fournit également du sang à la peau des fesses. Les artères font ensuite le tour du corps et se connectent aux vaisseaux sanguins du rectum et de l' artère périnéale.